1965年2月4日,中共中央主席毛澤東為修建北京地下鐵道批示:精心設計、精心施工。在建設過程中,一定會有不少錯誤失敗,隨時注意改正。?
1965年7月1日,北京地下鐵道一期工程在玉泉路以西兩棵白果樹下,舉行了開工典禮,黨和國家領導人朱德、鄧小平、彭真、李先念、羅瑞卿等參加典禮儀式,并為工程破土奠基。
1981年4月20日,成立北京市地下鐵道公司,歸北京市公共交通總公司領導。
1989年7月15日,北京市市政管理委員會(89)就政管字第61號文根據市政府辦公廳(89)廳秘字第21號文通知:同意北京市地下鐵道公司更名為北京市地下鐵道總公司。
2001年7月26日,根據市委、市政府有關精神,組建北京市地鐵集團有限責任公司(簡稱地鐵集團公司)、北京地鐵建設管理有限責任公司(簡稱地鐵建設公司)和北京地鐵運營有限責任公司(簡稱地鐵運營公司)。改制后的地鐵集團公司為國有獨資公司,市政府為地鐵集團公司的出資者,以原市地鐵總公司及其所屬企業所的國有資產,作為對地鐵集團公司的出資。地鐵集團公司以獨立的法人財產,承擔地鐵建設的融資。地鐵集團公司以獨立的法人財產,承擔地鐵建設的融資還貸責任,實現本市地鐵建設的總體目標。同時,以投資的形式設立地鐵建設公司和地鐵運營公司。地鐵建設公司和地鐵運營公司均具有法人資格。
2003年11月17日,為適應我市軌道交通快速發展的需要,降低投融資成本,減輕財政負擔,北京市國資委下發《關于北京地鐵集團有限責任公司管理體制改革相關問題的通知》,將北京地鐵集團有限責任公司變更為北京市基礎設施投資有限公司(簡稱我公司),將地鐵建設公司和地鐵運營公司從原地鐵集團公司中分立出來,成立北京市軌道交通建設管理有限公司(簡稱建管公司)和北京市地鐵運營有限公司(簡稱運營公司),我公司承接原地鐵集團公司的投融資職能,近期以軌道交通投融資和線網管理為主,承擔基礎設施項目的立項、可行性研究、方案設計、線網研究等工作,負責軌道交通相關資源開發業務的經營研究,并與建管公司、運營公司通過委托合同確立各自的權利和義務。
截至2017年底,公司資產總額達到4830億元,凈資產達到1917億元,全資及控股企業增至61家,全系統職工3543人,累計實現凈利潤120.05億元,全年完成政府項目投資546億元,計劃內建設資金到位率100%,節約政府項目融資成本12.23億元,利潤總額25.09億元,歸屬母公司凈利潤15.14億元。國內信用評級為AAA級,國際信用評級A+級,向"打造國內一流交通基礎設施投融資公司"的戰略目標持續邁進。